上文“最危险的出家人，他创立的宗派推翻了元朝”我们谈到了白莲教。朱元璋这位靠着白莲教大起义推翻元朝的既得利益者，自身也是一位和尚，按照一般理解，以当时白莲教的社会熟悉程度，他是一名白莲教僧人的可能性很大，但是，他却也选择了与白莲教为敌。
朱元璋从信仰到排斥白莲教
元末农民大起义前，白莲教便开始动员反元了，例如泰定二年（1325年）郭菩萨就以“弥勒佛当有天下”号召起义；致和元年（1328年）广西的普宁县的一个和尚宣布起义，甚至建号改元。
朱元璋参加农民大起义后，自身独立成为一方诸侯后，改变了对白莲教（与明教信仰合流）的信仰，在至正二十四年（1364年）八月，攻击张士诚信仰白莲教“误中妖术，不解偈言之妄诞，酷信弥勒之真有，聚为烧香之党。根据汝颖，蔓延河洛。妖言既行，凶谋遂逞。焚荡城郭，杀戮良民，所在生灵，茶毒万状”
朱元璋开始走向了“禁止邪教”之路，然而，从他到崇祯白莲教都没有被禁绝过，原因何在？
白莲教已经成为了一种：无识百姓的一种互助姓宗教，他们属于社会最底层，只有依靠团体的力量才能保证生存。只要不消除不平等，他们就不可能消失。
因此，在朱元璋时期，白莲教在湖北、江西方面比较严重，朱元璋特别讨厌江西人，曾说：江西人最好词讼，动不动就打官司，这是很久就有的习惯。其实，这种习惯在现在看来挺好，为了自己的利益而付诸法律总比付诸强力要好。
明朝的白莲教起义
在明朝，白莲教的起义几乎就没有断过，朱元璋、朱棣父子都曾经遇到过。洪武六年（1373年）、洪武十二年（1379年）、洪武十四年、洪武十九年（1386年）、洪武二十年、洪武二十一年、洪武三十年（1397年）就发生了多次白莲教以弥勒佛的名义发动起义。永乐时期也同样如此。
其中，1379年四川眉县的彭普贵率领白莲教教徒攻陷了14个州县，是洪武时期最大的一次起义。
1397年，四川汉中的白莲教起义历史时间最长，直到永乐七年（1409年）才被镇压，田九成自称“汉明皇帝”，改元龙凤。
著名的白莲教首领山东滨州人唐赛儿在1420年发动起义，震惊朱棣和天下。永乐十八年（1420年）二月的唐赛儿起义更是有名儿，因为唐赛儿失踪，全天下的尼姑、出家女子都受到了审查，先后有数万人被捕。由此，白莲教起义潮暂告段落。
白莲教其实已经不再是宗教
经过这次起义失败后，白莲教开始更加世俗化。之前，茅子元创立的时候，主要是净土宗和民间鬼神信仰等，之后到了元末农民大起义时期，又杂糅了道教、佛教禅宗的一些教义。当然，还有人说杂糅了摩尼教，姑妄听之吧。
总之，在明朝，白莲教的起义仍然不少，名目更加杂糅了、更世俗化了。
最终，白莲教酝酿着更大地反抗，终于再次搞出了大动静。
其实，自从茅子元病逝之时起，白莲教其实就已经不是宗教门派了，更多的是另外一种人们互相依托的社会组织，只不过有着封建社会的鬼神思想存在，更显得团结。然而，在这团结的背后，仍然是六百年的剥削、强迫与不平等。
白莲教在嘉靖时期出现一位人物
众所周知，从朱元璋开始，流民问题就没有被解决，流民的出现主要是当地土壤不适合耕种、遭灾、地方政府错误的拆迁政策等。到了明代中叶，白莲教的组织已经和流民合流。
像成化时期荆襄地区的刘通、石龙；弘治时期河南的赵景隆等白莲教组织都是流民。前者的石龙自称汉王，建元征胜。后者自称宋王。在这点上，有一个很奇妙的对比。
明朝的建立和其他汉人政权都不同，并没有采用春秋战国时期的国名或者自己的封地，而是学习元朝自己建立了崭新的朝代名。但是，普通百姓起义时所采用的仍然是古老的朝代命名方式。
正德期间，山西人李福达再次以“弥勒佛降世”为旗号起义。
嘉靖时，四川蔡伯贯起义、浙江马祖师起义、河北张朝用起义。
万历时，云南李圆朗起义、浙江赵一平起义、福建吴建吴昌兄弟起义。
上述这些起义，除了李福达起义较为长期，曾引起大范围关注而且还为此引来嘉靖对朝臣的诛杀！嘉靖很让人奇怪，被杀的人明明是在保卫明朝，嘉靖竟然把造反的人保了起来。
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